学校2003年被国务院学位办批准为硕士学位授予单位，2009年获得临床医学专业学位授予权，2010年获得口腔医学专业学位授予权，2011年获得基础医学、临床医学、护理学一级学科硕士学位授予权，2012年获得全科医学、临床病理学专业学位授予权及卓越医生教育培养计划（“5+3”临床医学硕士专业学位研究生培养模式）。2014年获得药学、公共卫生、应用心理专业学位授予权。

学校现有基础医学、临床医学、护理学等3个硕士学位一级学科授权点，有临床医学、口腔医学、药学、公共卫生、应用心理等5个硕士专业学位授权点，有口腔临床医学、中西结合临床等40余个硕士学位二级学科授权点。

现有神经生物学、呼吸病学、预防医学与卫生学、分子影像学、口腔临床医学、免疫学等6个  “泰山学者”设岗学科，中西医结合临床、医学免疫学、口腔科学、临床营养支持中心（肝胆外科）、内科学、人体解剖与组织胚胎学、病理学与病理生理学、影像医学与核医学等8个省部级重点学科，临床营养与代谢、肿瘤分子生物学实验室、医学生物技术等3个省级重点实验室，医学人文研究中心1个省级人文社科基地，天然药物、生殖免疫、中医证候研究、脑中风、耳科遗传病、神经精神药理、呼吸睡眠、分子影像学等8个省级医药卫生重点实验室，中药现代化与新剂型开发1个山东省中医药重点实验室。