山东大学(青岛) “天然药物生物智造”课题组 “联合培养研究生”招生
一、课题组PI简介:
汤亚杰,山东大学(青岛)微生物技术国家重点实验室特聘教授,国家重点研发计划“合成生物学”重点专项首席科学家、国家重点研发计划“绿色生物/制/造”重点专项专家组专家。自2005年从MIT学成回国以来,主持的科研项目 “天然产物生物/制/造的理论与方法”获2016年湖北省自然科学一等奖,“工业微生物发酵关键技术及产业化”获2014年湖北省科技进步一等奖,2014年入选全国杰出专业技术人才,2014年入选国家“万人计划”科技创新领军人才,2016年获得国家杰出青年科学基金资助,2022 入选山东省泰山学者攀登专家,2024年先后当选英国皇家化学学会会士、英国皇家生物学会会士。
二、研究方向
长期致力于“天然药物生物智造”领域的教学与科研,建立了天然产物“新分子、新反应、新药物”上下贯通的“天然药物生物智造”研究新范式,为天然产物“出新率低、成药性差、合成效率低”研究瓶颈的突破提供解决方案。
1. 新分子:以鬼臼毒素作为研究对象,基于百万级药靶、千万级活性毒性/药代、亿级小分子化合物等数据库,构建预测分子结构改造的多任务学习训练集。基于临床患者需求建立人工智能辅助药物分子设计系统,采用trRosetta、diffusion等算法,迭代学习成药性,自主搭建药物分子智能设计模型。设计靶向性强、高效低毒、生物利用度高的鬼臼类衍生物。
2. 新反应:基于化学结构与反应规则相似性的RetroPath2.0等软件及分子设计的逆diffusion结构片段组装过程,构建目标产物生物合成途径的智能设计系统。探究非天然供体引入及其手性控制的酶学机理,建立目标产物人工生物合成途径,实现目标产物的“从无到有”。阐明人工生物合成途径与底盘细胞的适配机制,构建合成效率提升的细胞工厂,实现目标产物的“从低到高”。
3. 新药物:以临床价值为导向的新药创制为目标,构建临床肿瘤组织来源的不同分型癌症PDO和PDX药效评价模型,从新分子库中挖掘高活低毒的鬼臼类候选药物。深入开展候选药物的药代/毒代等成药性研究,推进候选药物申报临床试验,努力开发为具有全新抗肿瘤机制I类抗肿瘤新药。
三、申请条件
1. 生物学(合成微生物学、生物化工、结构生物学)、化学(生命有机化学、化学生物学)、药学(药化、药代、药理、药分)研究背景的在读博士/硕士生;
2. 需征得学校指导老师的同意;
3. 身体健康,具有踏实的作风、良好的人际沟通能力;
4. 具有较强的科研操作能力、具有较好的科研经验和较高的科研创新能力的申请者,优先考虑。
四、培养模式
征得原学校导师同意后,在山东大学进行博/硕士论文研究工作。
五、联系方式
有意申请者请将详细个人简历发送邮件至yajietang@sdu.edu.cn。邮件主题请写“申请者姓名 + 申请联合培养研究生”。
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