全日制硕士研究生享受研究生国家助学金，标准为每生6000元/学年，国家助学金覆盖面为100%（有固定工资收入的学生除外）。

根据上级主管部门分配的名额，表现特别优异的全日制在校硕士研究生可申请研究生国家奖学金，奖励标准为每生20000元/学年。

学校还为全日制硕士研究生设立“曲阜师范大学研究生学业奖学金”，额度每生每年5000元到8000元，学业奖学金的覆盖面为100%（有固定工资收入的 学生除外）：推免生、“985”高校全日制本科毕业生和“211”高校全日制本科毕业生、一志愿报考我校且入学综合成绩（包括初试和复试成绩）位列本专业 前20%的学生，第一学年可直接获得硕士一等学业奖学金，奖励标准为8000元；其他一志愿报考我校考生硕士研究生第一学年均可获得硕士二等学业奖学金， 奖励标准为6000元；调剂我校考生第一学年可获得硕士三等学业奖学金，奖励标准为5000元。高年级硕士研究生一等学业奖学金覆盖比例40%，奖励金额 8000元；二等学业奖学金覆盖比例40%，奖励金额6000元；三等学业奖学金覆盖比例20%，奖励金额5000元。

在校全日制硕士研究生还可申请优秀研究生奖学金、研究生单项奖学金、优秀研究生干部奖学金、优秀毕业研究生奖学金、研究生“圣地英才奖”、“华藏奖学金”以及研究生学位论文科研创新资助基金等。

研究生平均获得的助学金和奖学金总额高于所交学费。

学校设立“三助”岗位，在“三助”岗位工作的在校生学校每月发放400元的津贴；家庭经济困难的在校生，经申请和认定后，学校一次性发放困难补贴；经济困难学生亦可申请生源地信用助学贷款，最高额度不超过12000元/学年。

学校提供专项资金支持研究生参加国内外的学术讨论交流活动。