中国科学院水生生物研究所(简称水生所)历史悠久，积累深厚。座落于湖北省武汉市风景秀丽的珞珈山麓、东湖之滨。它的前身是1930年在南京成立的国立中央研究院自然历史博物馆，1954年由上海迁至武汉。
　　水生所科学研究的总目标是根据国家需求，针对水生态环境不断恶化和水质性缺水日趋严重的这一我国和世界性重大问 题，发展淡水生态学、水生生物多样性与资源保护、渔业生物技术和水环境工程研究，并通过这些研究在基础、应用基础与应用三个研究层次上的有机结合，为我国 的水生态环境保护、渔业模式优化和水生生物资源可持续利用作出基础性、战略性和前瞻性贡献，攀登水生态环境保护和渔业可持续发展研究的科学高峰，将水生所 建成具有高学术地位和独特作用的、代表国家最高水平和国际著名的研究机构。
　　目前水生所设有水生生物多样性与资源保护研究中心、淡水生态学研究中心、渔业生物技术研究中心、水环境工程研究中心、水环境与人类健康研究中心、藻类生物学及应用研究中心。
　　拥有淡水生态与生物技术国家重点实验室、水生生物多样性与保护重点实验室、国家淡水渔业工程技术研究中心(武汉)、东湖湖泊生态系统开放试验站(国家 级)、湖北省水体生态工程技术研究中心、武汉市水环境工程研究中心。建有亚洲最大的淡水鱼类博物馆，拥有白鱀豚馆以及中国最大的淡水藻种库。配有100多 亩的鱼类和水生生物育种基地。
　　自2001年进入中国科学院知识创新工程试点以来，水生所进入了一个新的历史发展阶段。通过凝炼目标和结构调整，承担国家重大课题的能力明显增强，一 大批包括"973"、"863"、重大科技攻关、自然科学基金重大和重点等千万和百万级的国家项目已由水生所的科学家领衔主持。