南开大学推免网上报名系统不能替代教育部推免服务系统（址:http://yz.chsi.com.cn/tm），因此即便通过“南开推免系统”报名的学生还需要在“教育部推免服务系统”中报名。凡是没有通过“教育部推免服务系统”报名并在系统中接收录取的学生推荐免试接收一律无效。目前“教育部推免服务系统”尚未开通。

“南开推免系统”将早于“教育部推免服务系统”开通前关闭，学生如果没有在“南开推免系统”报名，待“教育部推免服务系统”开通后，仍可通过“教育部推免服务系统”选择报考南开大学。