第二军医大学创建于1949年，作为一所地处上海市的部属高校，隶属于中国人民解放军总后勤部，是国家“211工程”、军队“2110工程”重点建设院 校，是首批招收研究生的部队院校和首批博士、硕士学位授予单位。2004年获教育部批准正式成立研究生院，是上海市拥有研究生院的5所高校之一，是全军拥 有研究生院的3所院校之一，也是全国56所拥有研究生院的院校之一。现有博士学位授权一级学科10个，硕士学位授权一级学科16个；拥有基础医学和药学两 个国家一级重点学科，生理学、遗传学、内科学（消化系病）、外科学、影像医学与核医学和中西结合临床等六个国家二级重点学科。现有两院院士6名、教育部 “长江学者”特聘教授9名、“973”和“863”首席科学家10名、国家杰出青年基金获得者24名。“十五”以来，学校先后获得了国家最高科学技术奖、 国家科技进步创新团队奖、国家科技进步一等奖、5项国家自然科学二等奖等高等级成果。学校通过构建创新课程体系、完善创新激励机制、浓厚创新学术氛围等有 效举措，不断优化创新人才培养体系，为提升研究生科研创新能力搭建平台，优秀论文数量名列前茅，自1999年，我校先后获得“全国百篇优秀博士学位论 文”18篇，名列全国医科院校第1，全国院校第24。

    学校下设长海医院、长征医院和东方肝胆外科医院等3所三级甲等附属医院，其中肝胆外科、胸心外科、烧伤外科、骨科、神经外科、泌尿外科最具传统优势，另在 肝脏、肾脏等器官移植术，前列腺疾病微创治疗术，以及胰腺疾病、血管病、血液病、真菌病诊疗技术方面独具鲜明特色。