中国科学院北京基因组研究所《生物信息学》考试大纲

        本《生物信息学》考试大纲适用于中国科学院研究生院报考生物信息学专业的硕士研究生入学考试。生物信息学是生物学的一个新兴分支学科，它采用信息科学、计算机科学、生物数学、比较生物学等学科的观点和方法对生命的现象及其组成分子（核酸、蛋白质等）进行研究，主要研究生命中的本质和规律，包括物质组成、结构功能、生命体的能量和信息交换传递等。生物信息学包含了对基因组研究相关生物信息的获取、加工、存储、分配、分析和解释等。要求考生对基本概念有较深入的了解，能够系统地掌握生物信息学常用数据库及软件和算法。

一．考试内容

1． 什么是生物信息学？
1 ）基本概念
2 ）研究内容
3 ）发展方向

2． 基因组基本知识
1 ）基因组构成
2 ）基因组注释
3 ）基因组测序方法
4 ）基因组多态性

5 ）比较基因组

3． 转录组基本知识
1 ） DNA 到 mRNA 的转录
2 ）基因表达调控
3 ）转录组研究方法
4 ） mRNA 的反转录与 cDNA

4． 蛋白组基本知识

1） 蛋白质表达

2） 蛋白质的修饰与折叠

3） 蛋白质与核酸、蛋白质与蛋白质相互作用

4） 蛋白质组研究方法

5． 基因工程技术
1 ）分子克隆
2 ） PCR
3 ）转基因及其应用

6． 生物信息数据库
1 ）重要生物信息中心
2 ）常用数据库（包括 DNA 序列数据库、基因组数据库及蛋白质序列及结构数据库）
3 ）常见的生物信息数据格式

7． 常用软件及算法
1 ）动态规划与序列联配算法及软件
2 ）隐马模型与基因预测算法及软件
3 ）多序列联配算法及软件
4 ）进化及亲缘树计算软件
5 ）蛋白质结构预测软件

二．考试要求

1． 掌握生物信息学的基本概念、主要研究内容及基本研究方法；

2． 了解生物信息学最新进展；

3． 具有运用基础理论和基本软件及数据库进行分析问题与解决问题的能力。

三．主要参考书目