中国科学院地球化学研究所于1966年2月在贵阳成立，其主体由中国科学院地质研究所从北京搬迁而来。研究所具有很好的基础。在国内率先建立了矿床地球化学、环境地球化学、天体化学、高温高压实验地球化学、同位素地球化学、流体包裹体地球化学等地球化学学科体系；是我国首批具有博士、硕士学位授权单位、首批博士后流动站建站单位和全国一级学会—中国矿物岩石地球化学学会挂靠单位；作为主持单位取得了包括获国家自然科学一等奖在内的一系列重要学术成果；在研究所工作的11位科学家先后入选中国科学院院士。
地球化学研究所的战略定位是，围绕国家战略需求和国际地球科学前沿，以地球和行星演化、地球各圈层物质循环的地球化学过程及其资源环境效应为主线，开展基础性、战略性和前瞻性研究，完善和创新地球化学理论和应用体系，提升解决我国固体矿产资源开发与生态环境治理等问题的科技支撑能力，为地球化学学科发展和国民经济建设作出重要贡献，成为我国地球和行星演化、固体矿产资源与喀斯特生态环境研究的重要基地及地球化学优秀人才的培养摇篮。
研究所目前有在职职工400余人（含博士后）、硕士和博士研究生300余人，科技人员70%以上具有博士学位，2011年首批整体进入中国科学院“创新2020”择优支持行列，主持有较多国家973项目、国家基金重点项目、国家杰出青年基金项目、重大国际合作项目等重要科技任务，具有广泛的国内外交流与合作，现建有矿床地球化学国家重点实验室、环境地球化学国家重点实验室、地球内部物质高温高压实验室和月球与行星科学研究中心等研究实体。研究所的分析测试和实验研究设施先进，基本建成了微区成分—结构—形貌观测系统、元素—同位素分析测试系统、理论和实验模拟系统等高水平的系列研究平台，是我国地球与行星科学研究和人才培养的重要基地之一。
